Питання фінансування найбільш важливих природоохоронних та ресурсозберігаючих заходів вирішується через їх включення до відповідних державних і місцевих природоохоронних програм, які повинні мати чіткі механізми та джерела як бюджетного, так і позабюджетного фінансування їх реалізації, в тому числі за рахунок коштів фондів охорони навколишнього природного середовища, як державного так і місцевих.

            Пунктами 20 ст. 6 та 5 ст. 48 Закону України «Про державний бюджет України на 2009 рік» встановлено наступний розподіл надходжень коштів від збору за забруднення навколишнього природного середовища: 30 % - до Державного, 20 % - до місцевих (міських, сільських, селищних), 50 %  - до обласних та Автономної Республіки Крим, а між Київським та Севастопольським міським та Державним фондами охорони навколишнього природного середовища у співвідношенні 70 та 30 відсотків.

            Також слід зазначити, що, починаючи з 2009 року, на період підготовки та проведення фінальної частини чемпіонату Європи 2012 року з футболу в Україні, до міських бюджетів приймаючих міст обласного значення та міста Києва зараховується 70 % збору за забруднення навколишнього природного середовища.

            Такий розподіл коштів збору за забруднення навколишнього природного середовища дозволяє збільшити фінансування невідкладних природоохоронних заходів в регіонах.