На побережье Азовского моря от  государственной  границы  Украины  с  Российской Федерацией (Новоазовский район Донецкой области), и до  мыса Казантип (ПГТ Щелкино) находятся два крупных морских торговых порта – это Мариупольский и Бердянский. В этих портах проводится экологический контроль специалистами Государственной экологической инспекции Азовского моря. Данный вид контроля распространяется на товары, имеющие вероятность загрязнения окружающей среды - транспортные средства и грузы. А это большой объем работы - только за 9 месяцев 2009 года экологический контроль прошло более 5 млн. тон грузов.

            Кроме этого, в портах осуществляет и радиологический контроль, цель которого - выполнение требований действующего законодательства при перемещении через государственную границу радиоактивных веществ и ядерных материалов. Радиологический контроль всех грузов, пересекающих государственную границу Украины, является обязательным. Этот вид контроля также осуществляется специалистами Инспекции. В течении 9 месяцев 2009 года радиологическому контролю подверглось 6,7 млн. тонн грузов.

            Иногда, в ходе экологического контроля грузов и транспортных средств инспекторами выявляются грубые нарушения природоохранного законодательства, которые предусматривают кроме административной ответственности и более строгие меры, а именно – задержка груза или транспортного средства. В этом году Инспекцией было проверено более 800 транспортных средства, и выявлено более 530 нарушений. Виновные привлечены к административной ответственности. Сумма штрафов превышает 78 тысяч гривен.

            В Мариупольском и Бердянском порту в 2009 году произошло 11 случаев загрязнения акватории Азовского моря. Ущерб, нанесенный окружающей среде, составил  более 37 тысяч гривен, которые в полной мере возмещены нарушителями и пошли в фонд государства.